sekvenování DNA
sekvenování DNA je laboratorní metoda používá k určení sekvence DNAmolecule. Metodu vyvinul Frederick Sanger v roce 1975, který byl později oceněn Nobelovou cenou za chemii v roce 1980 za své příspěvky k sekvencím DNA. V důsledku toho se často označuje jako Sanger sekvenování.
v sekvenování Sanger, DNA, která má být sekvencovánaslouží jako šablona pro syntézu DNA. Dna primer je navržen tak, aby astarting bod pro syntézu DNA na řetězci DNA, které mají být sekvenovány., Jsou prováděny čtyřiindividuální reakce syntézy DNA. Čtyři reakce includenormal A, G, C, a T deoxynucleotide trifosfáty (dntp), a každý containsa nízká úroveň jedné ze čtyř dideoxynucleotide trifosforečnanů (ddNTPs): ddATP,ddGTP, ddCTP, nebo ddTTP. Čtyři reakce mohou být pojmenovány A, G,C A T, podle kterého ze čtyř ddNTPs byl zahrnut. Když je ddntp začleněn do řetězce nukleotidů, syntéza končí. Je to proto, že molekula ddNTP postrádá 3 ‚ hydroxylovou skupinu, která je nutná k vytvoření spojení s dalším nukleotidem v řetězci., Vzhledem k tomu, že ddNTPs jsou náhodnězařazené, syntéza končí na mnoha různých pozicích pro každýreakce.
po syntéze jsou produkty reakcí A, G, C a Tindividuálně naloženy do čtyř pruhů jednoho gelu a odděleny pomocí gelelektroforézy, metody, která odděluje fragmenty DNA podle jejich velikostí. Gelové pásky jsou detekovány a sekvence je načtena ze spodku gel nahoře, včetně pásů ve všech čtyřech pruzích., Například, pokud nejnižší kapela přes všechny čtyři pruhy se objeví v reakci pruhu, pak první nukleotid v sekvenci je A. Pak pokud je další kapela z dolní části topappears v T pruhu, druhý nukleotidů v sekvenci je T, a tak dále.Vzhledem k použití dideoxynukleotidů v reakcích je sekvenování Sangerutaké se nazývá sekvenování „dideoxy“.