Articles

DNA-sekvensointi

DNA-sekvensointi on laboratoriomenetelmä, jota käytetään dnamoleculen sekvenssin määrittämiseen. Menetelmän kehitti Frederick Sanger vuonna 1975, joka sai Nobelin kemianpalkinnon vuonna 1980 lahjoituksistaan DNA-sekvenssien selvittämiseen. Näin ollen sitä kutsutaan usein Sanger sekvensointi.

Sanger-sekvensoinnissa sekvensoitava DNA säilyy DNA-synteesin mallina. DNA-pohjamaali on suunniteltu astarting kohta DNA-synteesin juosteen DNA sekvensoidaan., Neljä yksittäistä DNA-synteesireaktiota suoritetaan. Neljä reaktioita includenormal A, G, C ja T deoxynucleotide trifosfaateiksi (dNTPs), ja jokainen containsa alhainen taso yksi neljästä dideoxynucleotide trifosfaateiksi (ddNTPs): ddATP,ddGTP, ddCTP, tai ddTTP. Neljä reaktiot voivat olla nimeltään A, G, C ja T,joiden mukaan neljä ddNTPs oli mukana. Kun ddNTP-aine siirtyy nukleotidien ketjuun, synteesi päättyy. Tämä johtuu siitä, että ddNTP-molekyylistä puuttuu 3′ hydroksyyliryhmä, jonka on muodostettava linkki ketjun seuraavan nukleotidin kanssa., Koska ddntp: t ovat satunnaisestiporattuja, synteesi päättyy moniin eri paikkoihin eachreaction.

Seuraavat synteesi, tuotteiden A, G, C ja T reaktioita toteaa ladattu neljä kaistaa yhden geelin ja erotettu käyttäen gelelectrophoresis, menetelmä, joka erottaa DNA-fragmentit niiden koot. Geelin tangot havaitaan, ja sen jälkeen sekvenssi luetaan geelin alaosasta yläosaan, mukaan lukien kaistat kaikilla neljällä kaistalla., Esimerkiksi, jos alhaisin bändi poikki kaikki neljä kaistaa näkyy reaktio lane, sitten ensimmäinen nukleotidin sekvenssi on A. Sitten, jos seuraava bändi alhaalta topappears T lane, toisen nukleotidin sekvenssi on T, ja niin edelleen.Koska reaktioissa käytetään dideoksinukleotideja, Sanger-sekvensointia kutsutaan myös” dideoksi ” sekvensoinniksi.