liike, joka voisi kehittyä Moravian Kirkko aloitti Katolinen pappi nimeltä Jan Hus (englanniksi John Hus) alussa viidestoista luvulla. Kirkko perustettiin reaktiona roomalaiskatolisen kirkon käytäntöihin. Hus halusi palauttaa Kirkon Bohemia ja Moravia käytäntöjä varhaisen Kristinuskon: suorittaa liturgia kielellä ihmisiä, jolloin antaa ihmiset saada sekä leipää ja kuppi aikana ehtoollista, ja poistaa Paavin aneet ja ajatus kiirastulesta., Liike sai royal tukea ja tietty riippumattomuus jonkin aikaa, jopa leviää rajan yli Puolaan, mutta oli lopulta pakko sovellettava hallinnon Rooma.

Husin seuraajien varasuunnitelma teki Rooman kanssa sopimuksen, jonka avulla he pystyivät toteuttamaan suurimman osan opillisista tavoitteistaan tunnustaen samalla roomalaiskatolisen kirkon auktoriteetin; näitä kutsuttiin Utraquisteiksi., Loput Hussites jatkoi toimintaansa ulkopuolella Roman katolilaisuuden ja sisällä viisikymmentä vuotta Hus: n kuolema oli tullut itsenäisesti järjestetty kuin Böömin Veljet’ tai Yhtenäisyyttä Veljet. Tämä ryhmä säilyy Hussilaissotien teologia (joka myöhemmin nojata kohti Luterilainen opetukset), säilyttäen historiallisen piispuuden, jopa aikana vainon. Böömin Veljeskirkko perustettiin Kunvaldiin Böömiin vuonna 1457.

Moravialaiset olivat varhaisin Protestanttinen kirkko, joka kapinoi Rooman valtaa vastaan viitisenkymmentä vuotta ennen Martti Lutheria., Eräs epätavallinen ja (aikansa) järkyttävä uskomus oli se, että ryhmä lopulta keskittyi yleissivistykseen. 1500-luvun puolivälissä jopa 90% Tshekin maiden asukkaista oli protestantteja. Aateliston enemmistö oli protestantteja, Moravian kirkon perustamat koulut ja Kirjapainot kukoistivat. Hyvin usein veljiä suojelivat paikalliset aateliset, jotka liittyivät heidän riveihinsä puolustaakseen itsenäisyyttään Habsburg Wienistä., Keskellä 16-luvulla ei ollut yksittäinen kaupunki ilman Protestanttinen koulu tsekistä, ja monet oli enemmän kuin yksi, enimmäkseen kaksi-kuusi opettajia kussakin. Jihlava, rehtori Protestanttinen keskus Moravia, siellä oli kuusi koulua: kaksi tšekin, kaksi saksalaista, yksi tytöille ja yksi opetus latinaksi, joka oli tasolla korkea / kielioppi koulussa, opetusta latinan, kreikan ja heprean, Retoriikkaa, Dialektiikkaa, perusteet Filosofian ja taiteiden, sekä uskonnon mukaan Luterilainen Augustana., Koska Prahan yliopisto oli myös tiukasti protestanttien käsissä, paikallinen katolinen kirkko ei kyennyt kilpailemaan koulutuksen alalla. Siksi, Jesuiitat kutsuttiin tuella Katolinen Habsburg-hallitsijat, tšekin mailla ja luoda useita Katolisen oppilaitosten, ennen kaikkea Akatemian Prahassa ja Akatemian Olomouc, Moravian pääkaupunki.

Kuitenkin, aatelisto pystyi voima keisari Rudolf II kysymys Kirjain Majesteettinne vuonna 1609, turvata uskonnonvapautta Böömin Kuningaskunnan.,

Rudolf II oli onnistunut vuonna 1612 hänen veljensä, Keisari Matthias, joka yritti asentaa kiivaasti Katolisen Ferdinand Steiermark on Böömin valtaistuimelle (joka oli yhdistyivät kanssa, että Maaliskuun Määrin), mutta vuonna 1618 Protestanttisen Bohemian ja Moravian aatelisten, jotka pelkäsivät menettävänsä uskonnonvapaus (kaksi Protestanttiset kirkot on jo väkisin kiinni), alkoi Böömin Kapina. Kapina kukistettiin vuonna 1620 White Mountainin taistelussa., Tämän seurauksena paikalliset protestanttiset aateliset joko teloitettiin tai karkotettiin maasta Habsburgien pannessa katolisen (ja enimmäkseen saksankielisen) aateliston paikalleen. Tshekin kieli supistui vähitellen kommunikaatiovälineeksi talonpoikien välillä, jotka olivat usein lukutaidottomia. Aikakautta kuvataan yleisesti tšekkikansan synkkänä aikakautena.

protestanteille tarjottiin uhkavaatimusta., Heidän oli pakko valita joko jättää monia ja vaihtelevia kaakkois henkivallat, mitä oli Pyhän saksalais-Roomalaisen Keisarikunnan (pääasiassa Itävallassa, Unkarissa, Böömin, Määrin, Sleesian ja osia Saksasta ja sen monet valtiot), tai harjoitella heidän uskomuksia salaa. Veljet joutuivat toimimaan maan alla ja lopulta hajallaan kaikkialla Pohjois-Euroopassa niin paljon kuin Low Maat, missä Piispa John Amos Comenius yritti suoraan elpymistä., Suurin jäljellä olevien yhteisöjen Veljet olivat sijaitsee Lissa Puolassa, joka oli historiallisesti vahvat siteet Tsekit, ja pieni, eristetty ryhmien Määrissä.