Articles

DNS szekvenálás

A DNS szekvenálás egy laboratóriumi módszer, amelyet a Dnamolekula szekvenciájának meghatározására használnak. A módszert Frederick Sanger fejlesztette ki 1975-ben, aki később 1980-ban kémiai Nobel-díjat kapott a DNS-szekvenciák feldolgozásáért. Következésképpen, gyakran nevezik Sanger szekvenálás.

a Sanger-szekvenálásban a szekvenálandó DNS a DNS-szintézis sablonjaként szolgál. A DNS-alapozót úgy tervezték, hogy legyenkezdési pont a DNS szintéziséhez a szekvenálandó DNS-szálon., Négyegyéni DNS-szintézis reakciót végzünk. A négy reakcióba beletartozik a -, G -, C – és T-dezoxinukleotid-trifoszfátok (dNTPs), amelyek mindegyike a négy didoxinukleotid-trifoszfát (ddNTPs) egyikének alacsony szintjét tartalmazza: ddATP,ddGTP, ddCTP vagy ddTTP. A négy reakció neve a, G, C és T lehet,amely szerint a négy ddNTPs közül melyik szerepelt. Amikor egy ddNTP vanmagnukleotidok láncába tartozik, a szintézis megszűnik. Ennek oka az, hogy a ddNTP molekulában nincs 3′ hidroxilcsoport, amely a lánc következő nukleotidjával való kapcsolat kialakításához szükséges., Mivel a ddNTP-k véletlenszerűen vannakjelentett, a szintézis számos különböző pozícióban megszűnik.

a szintézist követően az A, G, C és T reakciók termékei egy gél négy sávjába kerülnek, és gelelectroforézissel elválasztják őket, egy olyan módszerrel, amely a DNS-fragmenseket méretük szerint választja el. A gél sávjait észlelik,majd a szekvenciát a gél aljáról a tetejére olvassák, beleértve mind a négy sáv sávot., Például, ha mind a négy sávon a legkisebb sáv jelenik meg az a reakciósávban, akkor a szekvencia első nukleotidja A. akkor ha a következő sáv alulról felfelé jelenik meg a T sávban, a szekvencia második nukleotidja T, stb.A reakciókban a didoxinukleotidok alkalmazása miatt a Sanger szekvenálást ” dideoxi “szekvenálásnak is nevezik.