Il movimento che si sarebbe sviluppato nella Chiesa Morava fu iniziato da un prete cattolico di nome Jan Hus (in inglese John Hus) all’inizio del XV secolo. La Chiesa fu fondata come reazione alle pratiche della Chiesa cattolica romana. Hus voleva riportare la Chiesa in Boemia e Moravia alle pratiche del cristianesimo primitivo: eseguire la liturgia nella lingua del popolo, permettere ai laici di ricevere sia il pane che il calice durante la comunione, ed eliminare le indulgenze papali e l’idea del purgatorio., Il movimento ottenne il sostegno reale e una certa indipendenza per un po’, diffondendosi anche attraverso il confine in Polonia, ma alla fine fu costretto ad essere soggetto al governo di Roma.

Una contingenza di seguaci di Hus strinse un accordo con Roma che permise loro di realizzare la maggior parte dei loro obiettivi dottrinali, pur riconoscendo l’autorità della Chiesa cattolica romana; questi furono chiamati Utraquisti., Gli hussiti rimanenti continuarono ad operare al di fuori del cattolicesimo romano e, entro cinquant’anni dalla morte di Hus, si erano organizzati in modo indipendente come “Fratelli boemi” o Unità dei Fratelli. Questo gruppo ha mantenuto la teologia hussita (che sarebbe poi magra verso insegnamenti luterani), pur mantenendo l’episcopato storico, anche durante la loro persecuzione. La Chiesa dei Fratelli Boemi fu fondata a Kunvald, in Boemia, nel 1457.

I Moravi furono la prima Chiesa protestante, ribellandosi contro l’autorità di Roma circa cinquanta anni prima di Martin Lutero., Una convinzione insolita e (per il suo tempo) scioccante era l’eventuale attenzione del gruppo sull’educazione universale. Entro la metà del 16 ° secolo ben il 90% degli abitanti delle terre ceche erano protestanti. La maggior parte della nobiltà era protestante, le scuole e le tipografie stabilite dalla Chiesa morava erano fiorenti. Molto spesso i Fratelli erano protetti da nobili locali che si univano ai loro ranghi per affermare la loro indipendenza da Asburgo Vienna., Entro la metà del 16 ° secolo non c’era una sola città senza una scuola protestante nelle terre ceche, e molti avevano più di uno, per lo più con due a sei insegnanti ciascuno. A Jihlava, principale centro protestante in Moravia, c’erano sei scuole: due ceche, due tedesche, una per ragazze e una che insegnava in latino, che era al livello di un liceo / liceo, tenendo conferenze su latino, greco ed ebraico, retorica, dialettica, fondamenti di filosofia e belle arti, così come la religione secondo l’augustana luterana., Con l’Università di Praga anche saldamente nelle mani dei protestanti, la chiesa cattolica locale non era in grado di competere nel campo dell’istruzione. Pertanto, i gesuiti furono invitati, con il sostegno dei governanti cattolici asburgici, a venire nelle terre ceche e a fondare un certo numero di istituzioni educative cattoliche, in primo luogo l’Accademia di Praga e l’Accademia di Olomouc, capitale della Moravia.

Tuttavia, la nobiltà fu in grado di costringere l’imperatore Rodolfo II a emettere Lettera di Maestà nel 1609, salvaguardando la libertà religiosa nel Regno di Boemia.,

Rodolfo II succedette nel 1612 da suo fratello, l’Imperatore Mattia, che hanno cercato di installare fieramente Cattolico Ferdinando di Stiria sul trono di Boemia (che è congiunta con quella del Marzo di Moravia), ma nel 1618 i Protestanti Boemi e Moravi nobili, che temevano di perdere la libertà religiosa (due delle chiese Protestanti di essere già chiusi), ha iniziato la Boemia Rivolta. La rivolta fu sconfitta nel 1620 nella battaglia di White Mountain., Di conseguenza i nobili protestanti locali furono giustiziati o espulsi dal paese mentre gli Asburgo misero al loro posto la nobiltà cattolica (e soprattutto tedesca). La lingua ceca fu gradualmente ridotta a un mezzo di comunicazione tra contadini, che erano spesso analfabeti. L’era è generalmente descritta come l’età oscura della Nazione ceca.

ai protestanti fu offerto un ultimatum., Furono costretti a scegliere di lasciare i molti e vari principati del sud-est di quello che era il Sacro Romano Impero (principalmente Austria, Ungheria, Boemia, Moravia, Slesia e parti della Germania e dei suoi numerosi stati), o di praticare le loro credenze segretamente. I Fratelli furono costretti ad operare sottoterra e alla fine si dispersero in tutta l’Europa settentrionale fino ai Paesi bassi, dove il vescovo Giovanni Amos Comenius tentò di dirigere una rinascita., Le più grandi comunità rimanenti dei Fratelli si trovavano a Lissa in Polonia, che aveva storicamente forti legami con i cechi, e in piccoli gruppi isolati in Moravia.