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DNAリガーゼ:構造-機構-機能

概要

大腸菌のDNAリガーゼは、分子量75,000のポリペプチドです。 同等のT4誘導酵素はやや小さい(63,000-68,000)。 両方の酵素は、隣接する5′-ホスホリルおよび3′-ヒドロキシル基の間のホスホジエステル結合の合成を触媒し、DPN(大腸菌)またはATP(T4)のピロリン酸結合の切断に結合するニック化された二重DNAにおける。, 両酵素によって触媒されるホスホジエステル結合合成は、これらの離散的な一連のステップで起こり、二つの共有結合中間体の関与を伴う(Fig. 1). 反応触媒E.coliリガーゼの定常速度論的解析はこの機構を支持し,さらに酵素-アデニル酸およびDNA-アデニル酸がホスホジエステル結合合成の直接経路において速度論的に重要な中間体であることを示した。

異常に熱安定性酵素の合成をもたらすDNAリガーゼの構造遺伝子に変異を有する大腸菌の株は、42℃で不可侵である。, 30℃で成長することができるが、変異体は、紫外線照射およびアルキル化剤によって引き起こされるそのDNAへの損傷を修復する能力において、この 42℃では、新たに複製されたすべてのDNAは短い10S”岡崎断片”の形であり、これらの条件下で生き残ることができなかった理由は、大腸菌の染色体の不連続合成に不可欠なライゲーションステップを維持できないことであることを示している。 したがって、DNAリガーゼは、大腸菌における正常なDNA複製および修復に必要な必須酵素である。, 精製DNAリガーゼは組換えDNA分子のinvitro構築に有用な試薬であることが証明されている。