före 2002 ledde 49ers all-time-serien 4-2, men sedan de blev NFC West division rivaler 2002 leder Seahawks serien 26-13. Rivaliteten ansågs en gång obetydlig, på grund av att de två lagen hade liten historia mot varandra och med båda lider betydande sträckor av medelmåttighet. Till exempel, medan Seahawks vann fyra raka divisionstitlar från 2004 till 2007, 49ers slutade på tredje eller fjärde plats varje säsong och hade inte en vinnande säsong från 2003 till 2010., På samma sätt drabbades Seahawks fyra raka förlorade säsonger från 2008 till 2011. Trots sin sträcka av medelmåttighet, Seahawks har förblivit konkurrenskraftiga i spel mot 49ers under dessa år, särskilt spel på Lumen Field, där deras värsta förlust för 49ers det var med endast tio poäng i 2006.

rivaliteten intensifierades i 2011, när långvariga college rival tränare-tidigare USC tränare Pete Carroll och tidigare Stanford coach Jim Harbaugh—tog över som huvudtränare, med Carroll blir Seahawks tränare i 2010, och Harbaugh blir 49ers tränare i 2011., Båda lagen utarbetade unga, mobila quarterbackar för att leda sina franchisetagare, Seattles Russell Wilson och San Franciscos Colin Kaepernick. Båda tränarna gjorde sina respektive franchise till fleråriga slutspelskonkurrenter, och från 2010 till 2014 vann antingen Seahawks eller 49ers NFC West championship.

De två lagen möttes i 2013 NFC Championship Game i Seattle med en resa till Super Bowl XLVIII på linjen, med Seahawks vinnande 23-17., Spelet slutade när Seahawks cornerback Richard Sherman, som Harbaugh tidigare coachade på Stanford, tippade ett slutzon pass som ledde till en spelslutande avlyssning. Sherman hade sin berömda postgame intervju omedelbart efteråt, ringer ut 49ers mottagare Michael Crabtree och hävdar att han är ”bästa hörnet i spelet”. Seattle gick att besegra Denver Broncos 43-8 i Super Bowl XLVIII för att vinna sin första Super Bowl championship. San Francisco hade representerat NFC i en förlorande ansträngning i Super Bowl XLVII föregående säsong.,

sedan utarbetandet Russell Wilson i 2012, Seahawks har dominerat rivaliteten, håller en 15-4 rekord mot 49ers i detta span.