De store deler av hjernen er bygd opp av ulike strukturer som hver har en unik og viktig funksjon.

hjernen styrer både frivillige handlinger, som å snakke og kjører, og ufrivillige handlinger som å puste og reflekser. Våre følelser, hukommelse og personlighet så vel som sansene våre—syn, berøring, hørsel, smak, lukt—stamme i hjernen vår. Hjernen fungerer som et enkelt organ, men er delt inn i områder av spesiell kompetanse og funksjon.,

forebrain, mellomhjernen og hindbrain utgjør de tre store deler av hjernen. Strukturer i forebrain inkluderer cerebrum, thalamus, hypothalamus, hypofysen, limbiske system, og olfactory pære. Mellomhjernen består av ulike cranial nerve kjerner, tectum, tegmentum, colliculi, og crura cerebi. Den hindbrain, også referert til som hjernestammen, som er laget av medulla, pons, cranial nerver, og bakre del av hjernen som kalles lillehjernen.,

Pinealkjertelen—ligger dypt i sentrum av hjernen, i midtlinjen mellom de to halvdelene; en del av det endokrine system, og produserer melatonin, som bidrar til å opprettholde døgnrytmen og regulere reproduktive hormoner, regulerer også andre endokrine funksjoner og konverterer signaler fra nervesystemet til endokrine signaler

Pons—hotellet ligger ovenfor den medulla oblongata; ansvarlig for å sende signaler eller meldinger mellom flere områder av hjernen, spesielt mellom øvre og nedre deler av hjernen; spiller en rolle i å sove og drømme