Når det ble klart at Diem hadde ingen intensjon om å holde valg for et forent Vietnam, hans politiske motstandere begynte å vurdere alternative måter å oppnå sine mål. Noen kom til den konklusjon at vold var den eneste måten å overtale Diem) for å godta vilkårene i 1954 Geneve-Konferansen. Ett år etter den annullerte valget så en stor økning i antall mennesker som forlater sine hjem for å danne væpnede grupper i skogene i Vietnam., Ved første de var ikke i en posisjon til å ta på den Sør-Vietnamesiske Hæren og i stedet konsentrert seg om det som ble kjent som «myke mål’. I 1959, anslagsvis 1,200 av Diem er embetsmenn ble drept.

Romerske Katolikker gjort opp for bare litt over 10% av befolkningen i Sør-Vietnam. Som en belønning for å ta i bruk religion av sine franske mestere. Katolikker hadde alltid hatt en privilegert posisjon i Vietnam. Den Katolske Kirke var den største landeieren i landet, og de fleste av de tjenestemenn som bidro til å administrere landet for den franske var Katolikker.,

Den viktigste religionen i Vietnam var Buddhismen. Undersøkelser utført i 1960-årene tyder på at rundt 70% av befolkningen var tilhengere av Buddha. Den franske, er klar over den potensielle trusselen om Buddhismen til deres myndighet, vedtatt lover for å motvirke sin vekst.

Etter den franske venstre Vietnam Katolikkene klarte å holde på sin makt i landet. Deim var en hengiven Katolikk og hadde en tendens til å oppnevne personer til posisjoner myndighet som delte sin religiøse tro. Dette provoserte Buddhister, spesielt når den nye regjeringen nektet å opphevelsen anti-Buddhistiske lover vedtatt av den franske.,

den Mai 8, 1963, Buddhister samlet i Hue for å feire 2527th bursdag til Buddha. Forsøk ble gjort av politiet for å spre folkemengder ved å åpne ild mot dem. En kvinne og åtte barn ble drept i deres forsøk på å flykte fra politiet.

Buddhister ble rasende og begynte en rekke demonstrasjoner mot Diem regjeringen. I et forsøk på å la verden få vite hvor sterkt de mente om den Sør-Vietnamesiske regjeringen, og det ble besluttet å be om frivillige til å begå selvmord.,

På juni 11, 1963, Thich Quang på Grunn av, en seksti-seks år gammel munk, satte seg ned midt i en travel Saigon veien. Han ble deretter omgitt av en gruppe av Buddhistiske munker og nonner som helte bensin over sitt hode, og deretter sette fyr på ham. Et øyenvitne senere kommenterte: «Som han brente han aldri flyttet en muskel, aldri ytret en lyd, hans ytre ro i skarp kontrast til den klagende folk rundt ham.»Mens Thich Quang på Grunn brant til døde, munker og nonner som ga ut brosjyrer ringer for Diem regjeringen til å vise nestekjærlighet og medfølelse» til alle religioner.,

Det er regjeringens svar på denne selvmord var å arrestere tusenvis av Buddhistiske munker. Mange forsvant og aldri ble sett igjen. Av August fem munkene hadde begått selvmord ved å sette ild til seg selv. Ett medlem av den Sør-Vietnamesiske regjeringen svarte på disse selv-immolations ved å fortelle en avis reporter: «La dem brenne, og vi skal klappe i hendene våre.»En annen som tilbys for å levere Buddhister som ønsket å begå selvmord med nødvendig bensin.

Disse hendelsene overbevist om at President John F., Kennedy som Diem ville aldri være i stand til å forene de Sør-Vietnamesiske mot kommunismen. Flere forsøk hadde allerede blitt gjort for å styrte Diem men Kennedy hadde alltid bedt om CIA og den AMERIKANSKE styrkene i Vietnam for å beskytte ham. For å få en mer populær leder av Sør-Vietnam, Kennedy var enige om at rollen som CIA bør endres. Lucien Conein, en CIA-agent, forutsatt at en gruppe av Sør-Vietnamesiske generals med en $40.000 for å gjennomføre kuppet med løfte om at AMERIKANSKE styrker ville gjøre noe forsøk på å beskytte Diem.,

i begynnelsen av November, 1963, President Diem ble styrtet ved et militærkupp. Etter generaler som hadde lovet Diem at han ville få lov til å forlate landet de forandret deres sinn og drepte ham. Han ble erstattet av Nguyen Van Thieu, stabssjef av de Væpnede Styrkene i Sør-Vietnam.