mișcarea care se va dezvolta în Biserica Moraviei a fost inițiată de un preot catolic pe nume Jan Hus (în engleză John Hus) la începutul secolului al XV-lea. Biserica a fost înființată ca o reacție la practicile Bisericii Romano-Catolice. Hus a vrut să readucă Biserica din Boemia și Moravia la practicile creștinismului timpuriu: efectuarea Liturghiei în limba poporului, permițând oamenilor laici să primească atât pâinea, cât și paharul în timpul comuniunii și eliminând indulgențele Papale și ideea purgatoriului., Mișcarea a câștigat sprijin regal și o anumită independență pentru o vreme, chiar răspândindu-se peste graniță în Polonia, dar în cele din urmă a fost forțată să fie supusă guvernării Romei.

Un plan de Hus adepții ajuns la o înțelegere cu Roma, care le-a permis să realizeze majoritatea lor doctrinare obiective, recunoscând autoritatea Bisericii Romano-Catolice; acestea au fost numite Utraquists., Husiții rămași au continuat să opereze în afara Romano-catolicismului și, în cincizeci de ani de la moartea lui Hus, au devenit organizați independent ca „frații boemi” sau unitatea fraților. Acest grup a menținut teologia husită (care avea să se aplece mai târziu spre învățăturile Luterane), menținând în același timp Episcopatul istoric, chiar și în timpul persecuției lor. Biserica Fraților boem a fost fondată în Kunvald, Boemia, în 1457.Moravienii au fost cea mai veche biserică protestantă, răzvrătindu-se împotriva autorității Romei cu aproximativ cincizeci de ani înainte de Martin Luther., O credință neobișnuită și (pentru timpul său) șocantă a fost concentrarea grupului asupra educației universale. Până la mijlocul secolului al XVI-lea, 90% dintre locuitorii din țările cehe erau protestanți. Majoritatea nobilimii era protestantă, școlile și tipografiile înființate de Biserica Moraviei înfloreau. Foarte adesea frații erau protejați de nobilii locali care s-au alăturat rândurilor lor pentru a-și afirma independența față de Viena Habsburgică., Până la mijlocul secolului al XVI-lea nu exista un singur oraș fără o școală protestantă în țările cehe și mulți aveau mai mult de unul, mai ales cu doi până la șase profesori fiecare. În Jihlava, un principal centru Protestant în Moravia, au fost șase școli: două cehă, doi germani, una pentru fete și una cu predare în limba latină, care a fost la nivelul de o mare / scoala de gramatica, cursuri în limba latină, greacă și ebraică, Retorică, Dialectică, bazele de Filosofie și arte plastice, precum și religia potrivit Luterană Augustana., Cu Universitatea din Praga, de asemenea, ferm în mâinile protestanților, Biserica Catolică locală nu a putut să concureze în domeniul educației. Prin urmare, iezuiții au fost invitați, cu sprijinul conducătorilor catolici Habsburgici, să vină în țările cehe și să înființeze o serie de instituții de învățământ Catolice, în primul rând Academia din Praga și Academia din Olomouc, capitala Moraviei.cu toate acestea, nobilimea a reușit să-l forțeze pe împăratul Rudolf al II-lea să emită o scrisoare de măreție în 1609, protejând libertatea religioasă în Regatul Boemiei.,

Rudolf al II-lea a fost succedat în 1612 de către fratele său, Împăratul Matthias care au căutat să instalați cu înverșunare Catolic Ferdinand de Styria pe Boem tron (care s-a unit cu cea din Martie din Moravia), dar în 1618 Protestante Boemia și Moravia nobili, care se temeau de pierderea libertății religioase (două dintre bisericile Protestante fiind deja închis cu forța), a început Boem Revoltă. Revolta a fost învinsă în 1620 în Bătălia de la Muntele Alb., În consecință, nobilii protestanți locali au fost fie executați, fie expulzați din țară, în timp ce Habsburgii au pus nobilimea Catolică (și mai ales germană) în locul lor. Limba cehă a fost redusă treptat la un mijloc de comunicare între țărani, care erau adesea analfabeți. Era este în general descrisă ca epoca întunecată a națiunii cehe.protestanților li s-a oferit un ultimatum., Ei au fost forțați să aleagă fie să părăsească numeroasele și variatele principate sud-estice ale ceea ce era Sfântul Imperiu Roman (în principal Austria, Ungaria, Boemia, Moravia, Silezia și părți din Germania și numeroasele sale state), fie să-și practice credințele în secret. Frații au fost forțați să opereze în subteran și, în cele din urmă, s-au dispersat în nordul Europei până în țările joase, unde Episcopul Ioan Amos Comenius a încercat să conducă o renaștere., Cele mai mari comunități rămase de frați au fost situate în Lissa în Polonia, care a avut legături istorice puternice cu cehii, și în grupuri mici, izolate în Moravia.