Articles

secvențierea ADN

secvențierea ADN este o metodă de laborator utilizată pentru a determina secvența unei DNAmolecule. Metoda a fost dezvoltată de Frederick Sanger în 1975, care a primit mai târziu Premiul Nobel pentru chimie în 1980 pentru contribuțiile sale la secvențele ADN remarcabile. În consecință, este adesea menționată ca secvențiere Sanger.

în secvențierea Sanger, ADN-ul care urmează să fie secvențiatservește ca șablon pentru sinteza ADN-ului. Un primer ADN este conceput pentru a fi unpunct de pornire pentru sinteza ADN-ului pe catena de ADN care urmează să fie secvențiată., Patrusunt efectuate reacții individuale de sinteză a ADN-ului. Cele patru reacții includenormal a, G, C și T deoxynucleotide trifosfați (dNTPs), și fiecare containsa nivel scăzut de una din cele patru dideoxynucleotide trifosfați (ddNTPs): ddATP,ddGTP, ddCTP, sau ddTTP. Cele patru reacții pot fi numite A, G, C și T,conform cărora dintre cele patru ddNTPs au fost incluse. Când este un ddntpincorporat într-un lanț de nucleotide, sinteza se termină. Acest lucru se datorează faptului că molecula ddNTP nu are o grupare hidroxil 3′, care este necesară pentru a forma o legătură cu următoarea nucleotidă din lanț., Din moment ce ddNTPs sunt incorporate aleator, sinteza se termină în multe poziții diferite pentru fiecare reacție.

în Urma sintezei, produsele a, G, C și T reacții areindividually încărcat în patru benzi de un singur gel și separat, folosind gelelectrophoresis, o metodă care separă fragmente de ADN de dimensiunile lor. Benzile gelului sunt detectate, iar apoi secvența este citită din partea de jos a gelului în partea de sus, inclusiv benzile din toate cele patru benzi., De exemplu, dacă banda cea mai joasă de pe toate cele patru benzi apare în banda de reacție A, atunci prima nucleotidă din secvență este A. Apoi, dacă următoarea bandă de jos în sus apare în banda T, A doua nucleotidă din secvență este T și așa mai departe.Datorită utilizării dideoxinucleotidelor în reacții, secvențierea Sanger estenumită și secvențiere „dideoxy”.