Când a devenit clar că Diem a avut intenția de a organiza alegeri pentru un unite, Vietnam, adversarii săi politici au început să ia în considerare modalități alternative de obținere a lor obiective. Unii au ajuns la concluzia că violența a fost singura modalitate de a-l convinge pe Diem să fie de acord cu Termenii Conferinței de la Geneva din 1954. Anul următor alegerilor anulate a înregistrat o creștere mare a numărului de persoane care își părăsesc casele pentru a forma grupuri armate în pădurile din Vietnam., La început, ei nu erau în măsură să preia Armata Sud-vietnameză și, în schimb, s-au concentrat asupra a ceea ce a devenit cunoscut sub numele de „ținte moi”. În 1959, aproximativ 1 200 de oficiali guvernamentali ai lui Diem au fost uciși.Romano-catolicii au constituit doar puțin peste 10% din populația din Vietnamul de Sud. Ca recompensă pentru adoptarea religiei stăpânilor lor francezi. Catolicii au avut întotdeauna o poziție privilegiată în Vietnam. Biserica Catolică a fost cel mai mare proprietar de pământ din țară și majoritatea oficialilor care au ajutat la administrarea țării pentru francezi erau catolici.,principala religie din Vietnam a fost budismul. Sondajele efectuate în anii 1960 sugerează că aproximativ 70% din populație erau adepți ai lui Buddha. Francezii, conștienți de amenințarea potențială a budismului pentru autoritatea lor, au adoptat legi pentru a descuraja creșterea sa.după ce francezii au părăsit Vietnamul, catolicii au reușit să-și păstreze puterea în țară. Deim era un catolic devotat și avea tendința de a numi oameni în poziții de autoritate care împărtășeau convingerile sale religioase. Acest lucru i-a înfuriat pe budiști, mai ales când noul guvern a refuzat să abroge legile anti-budiste adoptate de francezi.,la 8 mai 1963, Budiștii s-au adunat în Hue pentru a sărbători cea de-a 2527-a aniversare a lui Buddha. Încercările au fost făcute de poliție pentru a dispersa mulțimile prin deschiderea focului asupra lor. O femeie și opt copii au fost uciși în încercările lor de a fugi de poliție.Budiștii s-au înfuriat și au început o serie de demonstrații împotriva guvernului Diem. În încercarea de a lăsa lumea să știe cât de puternic au simțit despre guvernul sud-vietnamez, sa decis să ceară voluntarilor să se sinucidă.,la 11 iunie 1963, Thich Quang Due, un călugăr de șaizeci și șase de ani, s-a așezat în mijlocul unui drum aglomerat din Saigon. El a fost apoi înconjurat de un grup de călugări budiști și călugărițe care i-au turnat benzină peste cap și apoi i-au dat foc. Un martor ocular a spus mai târziu: „în timp ce ardea, nu mișca Niciun mușchi, nu scotea niciun sunet, calmul său exterior contrastând puternic cu oamenii care plângeau în jurul lui.”În timp ce Thich Quang Due ardea de moarte, călugării și călugărițele au dat pliante în care cereau guvernului lui Diem să arate „caritate și compasiune” tuturor religiilor.,răspunsul guvernului la această sinucidere a fost arestarea a mii de călugări budiști. Mulți au dispărut și nu au mai fost văzuți niciodată. Până în August, alți cinci călugări s-au sinucis dându-și foc. Un membru al Guvernului Sud-vietnamez a răspuns la aceste auto-incendieri spunându-i unui reporter de ziar: „lăsați-i să ardă și vom bate din palme.”Altul s-a oferit să furnizeze budiștilor care doreau să se sinucidă cu benzina necesară.aceste evenimente l-au convins pe președintele John F., Kennedy că Diem nu ar putea niciodată să-i unească pe sud-vietnamezii împotriva comunismului. Mai multe încercări au fost deja făcute pentru a răsturna Diem, dar Kennedy a instruit întotdeauna CIA și forțele militare americane din Vietnam să-l protejeze. Pentru a obține un lider mai popular al Vietnamului de Sud, Kennedy a fost de acord că rolul CIA ar trebui să se schimbe. Lucien Conein, un agent CIA, a oferit unui grup de generali sud-vietnamezi 40.000 de dolari pentru a efectua lovitura de stat cu promisiunea că forțele americane nu vor încerca să-l protejeze pe Diem.,la începutul lunii noiembrie 1963, președintele Diem a fost răsturnat de o lovitură de stat militară. După ce generalii i-au promis lui Diem că i se va permite să părăsească țara, s-au răzgândit și l-au ucis. El a fost înlocuit de Nguyen Van Thieu, șeful Statului Major al Forțelor Armate din Vietnamul de Sud.