Egy autista gyerek szállítására ritka mutációk DNS szegmensek szárny gének, illetve irányítani a kifejezést—, s hajlamosak örökölni ezek a mutációk a változatlan atyák, egy tanulmány szerint megjelent ma a Science1.

a megállapítás váratlan, mivel a legtöbb tanulmány az autizmus kockázatának kitett anyáktól örökölt mutációkat tartalmaz., Ezért egyes szakértők szkeptikusak az eredményekkel kapcsolatban.

a tanulmány a legnagyobb még annak feltárására, hogy a géneken kívüli mutációk hogyan járulnak hozzá az autizmushoz: 9,274 teljes genom elemzésén alapul. És a “strukturális változatokra” — törlésekre vagy DNS-másolatokra-összpontosít ezekben a kódolatlan régiókban. Miután elbocsátották “szemét DNS-ként”, ezeknek a régióknak némelyikéről ismert, hogy szabályozza a gének expresszióját.,

“Ezek azok a változatok, amelyeket korábban, ha klinikai genetikai vizsgálatot végezne, figyelmen kívül hagyna” – mondja Jonathan Sebat vezető kutató, a San Diegói Kaliforniai Egyetem genomikai és Neuropyschiatric betegségek Beyster Központjának vezetője.

a változatok összességében csak az autista egyének kis részét teszik ki: becslések szerint 0, 39-1, 13 százalék.

“Ez nagyon alacsony”, és a tartomány meglehetősen széles, mondja Yufeng Shen, a Columbia Egyetem rendszerbiológia és orvosbiológiai informatika adjunktusa, aki nem vett részt a munkában., “Nagyon szeretem ezt a papírt; nagyon jó” – mondja, de ” egy nagyobb minta képes lenne pontosabban megbecsülni ezt a frakciót.”

Scouring sequences:

Sebat és kollégái szekvenálták 311 család genomját, akiknek legalább egy autista gyermekük van. Elemezték továbbá 518 autista és nem érintett szülő-és testvérpár genomját is.

Sebat csapata 100 vagy több DNS-betű szerkezeti változatát észlelte. Átlagosan körülbelül 3700 ilyen örökölt változatot találtak egy személyben.,

ezután azokra a területekre összpontosítottak, amelyek az általános populációban ritkán mutálódnak. (Az alternatíva az lenne, ha a genomok egészét “agnosztikus” módon tekintenék meg.) Megállapították, hogy az autista gyermekek körülbelül kétszer annyi ritka változatot örökölnek apjuktól, mint amennyit véletlenül elvárnának. Ezzel szemben az anyáktól örökölt ritka változatok minimális mértékben hozzájárulnak az autizmushoz, találták. Nem azonosítottak semmilyen nem engedélyezett, vagy de novo, az autizmushoz kapcsolódó mutációkat.

Sebat és kollégái 2017 márciusában közzétették eredményeiket egy preprint szerveren., Ezután validálták megállapításaikat egy független mintában, 1771 családból, akiknek legalább egy autista gyermeke van.

Ez a stratégia magas mércét állított fel a tudományos szigorra-mondja Sebat.

“mielőtt elvégeztük a replikációt, mindenkinek elmondtuk, hogy mi az eredmény, és hogyan végeztük el az elemzést” – mondja. “Teljesen átláthatóak voltunk abban, hogy milyen hipotéziseket fogunk tesztelni a replikációs mintában, és hogyan fogjuk csinálni.”

mások szerint a replikáció fokozza a tanulmány hatását., “Bátorít az eredmény replikációja” – mondja Evan Eichler, a seattle-i Washington Egyetem genomtudományi professzora, aki nem vett részt a vizsgálatban.

következtetések összehasonlítása:

a Sebat eredményei azonban közvetlenül ellentmondanak két másik csapat eredményeinek, amelyek ugyanazokat a szekvenciákat elemezték: egyik csapat sem talált örökölt szerkezeti változatokat az autizmushoz nem kódoló régiókban.

az Eichler által vezetett egyik csoport októberben jelentette, hogy az autizmushoz kapcsolódó “de novo” mutációkat találtak a nem kódolt DNS-ben., A másik csapat tanulmánya a sajtóban van, de nem talált sem örökölt, sem de novo variánsokat az autizmushoz kapcsolódóan a régiókban.

az eltéréseket részben a csapatok által alkalmazott algoritmusok és módszerek közötti különbségek magyarázhatják – mondta Lucia Peixoto, a Washingtoni Állami Egyetem orvosbiológiai tudományok adjunktusa, aki egyik vizsgálatban sem vett részt. “Tehát valóban nem hasonlíthatók össze” – mondja. Például a sajtóban végzett tanulmány az agnosztikus megközelítést alkalmazta.,

Sebat elemzése szintén nem tartalmazott apró deléciókat és duplikációkat, amelyeket indeleknek neveznek, amelyek sokkal bőségesebbek a genomban, mint a nagyobb változatok-mondja Michael Talkowski, a Harvard Egyetem neurológia docense, aki a tanulmányt a sajtóban vezette. Az elemzés összes eredményének bevonása megváltoztathatja a következtetést-mondja.

“ezek a korai napok a teljes genom feltárásában” – mondja Talkowski., “Gyanítom, hogy drámaian nagyobb mintákra lesz szükségünk, és össze kell hangolnunk a jegyzeteinket és megközelítéseinket, mielőtt értékelnénk a valódi replikációt ezeken a tanulmányokon, és összehasonlítható következtetésekre jutnánk.”

védőhatás:

Az eredmények ellentétesek az autizmus uralkodó elméletével, a “női védőhatással”.”Ezen elmélet szerint a nőket valahogy megvédik az autizmust kiváltó mutációktól, de néha átadják a mutációkat a fiaiknak.,

mi több, az autizmushoz kapcsolódó genetikai változatok egyetlen más osztálya sem mutat apai öröklési mintát, jegyzi meg Stephan Sanders, a San Francisco-i Kaliforniai Egyetem pszichiátriai adjunktusa. Sanders volt a tanulmány egyik vezetője a sajtóban.

“nem egyezik meg a női védőhatással, amelyre jelentős bizonyítékok vannak, és amelyek nem jósolják meg az apai úton terjedő változatok feleslegét bármely variációs osztályban” – mondja.

Sebat szerint a megállapítások nem ellentétesek ezzel az elmélettel., Szerinte az autizmus az anyától örökölt erős kódoló mutáció és az apától örökölt, kevésbé erős, nem kódoló mutáció kombinációjából eredhet.

csapata azt tervezi, hogy több teljes genomot elemez, amint elérhetővé válnak. Nagyobb mintamérettel, mondja Sebat, képes lesz tesztelni ezt a “kétütéses” hipotézist. Csapata az általuk feltárt nem kódoló mutációk hatásait is vizsgálja.