risc mic: mutațiile transmise de la tați sunt susceptibile să reprezinte doar aproximativ 1% din cazurile de autism.unii copii cu autism poartă mutații rare în segmentele ADN care flanchează genele și le controlează expresia — și tind să moștenească aceste mutații de la tații lor neafectați, potrivit unui studiu publicat astăzi în Science1.constatarea este neașteptată deoarece majoritatea studiilor implică mutații moștenite de la mame cu risc de autism., Din acest motiv, unii experți sunt sceptici față de rezultate.studiul este cel mai mare care a explorat încă modul în care mutațiile din afara genelor contribuie la autism: se bazează pe o analiză a 9.274 de genomi întregi. Și se concentrează pe „variante structurale” — ștergeri sau duplicări în ADN-în aceste regiuni care nu codifică. Odată respinse ca „ADN junk”, unele dintre aceste regiuni sunt acum cunoscute pentru a controla expresia genelor.,

„Acestea sunt tipurile de variante care, înainte, dacă ai făcut-o clinică teste genetice, te-ar ignora”, spune investigatorul principal Jonathan Sebat, șef al Beyster Centrul de Genomică și Neuropyschiatric Boli de la Universitatea din California, San Diego.

variantele reprezintă în general doar o mică proporție de persoane cu autism: o valoare estimată de 0, 39 până la 1, 13 la sută.

„este foarte scăzut”, iar gama este destul de largă, spune Yufeng Shen, profesor asistent de biologie a sistemelor și Informatică biomedicală la Universitatea Columbia, care nu a fost implicat în lucrare., „Îmi place foarte mult această lucrare; este foarte bună”, spune el, dar ” un eșantion mai mare ar putea estima această fracțiune mai precis.Sebat și colegii săi au secvențiat genomul a 311 familii care au cel puțin un copil cu autism. De asemenea, au analizat genomul a 518 persoane cu autism și părinții și frații lor neafectați.echipa lui Sebat a detectat variante structurale de 100 sau mai multe litere ADN. Ei au găsit o medie de aproximativ 3.700 de astfel de variante moștenite în orice persoană.,ei s-au concentrat apoi pe zonele care flancează genele care sunt rareori mutate în populația generală. (Alternativa ar fi să privim genomul în ansamblu, într-un mod „agnostic”.) Au descoperit că copiii cu autism moștenesc aproximativ de două ori mai multe variante rare de la tații lor decât ar fi de așteptat din întâmplare. În schimb, variantele rare moștenite de la mame aduc o contribuție minimă la autism, au descoperit. Ei nu au identificat nici o mutație nemoștenită sau de novo legată de autism.

Sebat și colegii săi și-au postat rezultatele pe un server de preprint în martie 2017., Apoi și-au validat concluziile într-un eșantion independent de secvențe din 1771 de familii care au cel puțin un copil cu autism.această strategie a stabilit un bar înalt pentru rigoarea științifică, spune Sebat.

„înainte de a face replicarea, am spus tuturor care a fost rezultatul și cum am făcut analiza”, spune el. „Am fost complet transparenți în ceea ce privește ipotezele pe care urma să le testăm în eșantionul de replicare și cum urma să o facem.”

alții spun că replicarea sporește impactul studiului., „Sunt încurajat de replicarea rezultatului”, spune Evan Eichler, profesor de științe ale genomului la Universitatea Washington din Seattle, care nu a fost implicat în studiu.cu toate acestea, rezultatele lui Sebat contrazic direct cele ale altor două echipe care au analizat unele dintre aceleași secvențe: niciuna dintre aceste Echipe nu a găsit variante structurale moștenite legate de autism în regiunile care nu codifică.una dintre echipe, condusă de Eichler, a raportat în octombrie că au găsit mutații „de novo” legate de autism în ADN-ul noncodant., Studiul de la cealaltă echipă este în presă, dar nu a găsit nici variante moștenite, nici de novo legate de autism în regiuni.discrepanțele ar putea fi explicate parțial prin diferențele dintre algoritmii și metodele utilizate de echipe, spune Lucia Peixoto, profesor asistent de științe biomedicale la Universitatea de Stat din Washington Spokane, care nu a fost implicat în niciunul dintre studii. „Deci nu sunt cu adevărat comparabile”, spune ea. De exemplu, studiul în presă a folosit abordarea agnostică.,

Sebat analiza, de asemenea, nu includ mic deleții și duplicații numit indels, care sunt mult mai abundente în genomul mult mai mare de variante, spune Michael Talkowski, profesor asociat de neurologie la Universitatea Harvard, care a co-a condus studiul în presă. Includerea tuturor acestor rezultate în analiză ar putea schimba concluzia, spune el.”acestea sunt primele zile în explorarea întregului genom”, spune Talkowski., „Bănuiesc că vom avea nevoie de eșantioane dramatic mai mari și de a alinia adnotările și abordările noastre, înainte de a putea evalua replicarea adevărată în aceste studii și de a ajunge la concluzii comparabile.”

efect protector:

rezultatele sunt, de asemenea, în contradicție cu o teorie predominantă a autismului, ” efectul protector feminin. Conform acestei teorii, femeile sunt cumva protejate de mutații care ar putea declanșa autismul, dar uneori transmit mutațiile fiilor lor.,mai mult, nicio altă clasă de variante genetice legate de autism nu prezintă un model de moștenire paternă, notează Stephan Sanders, profesor asistent de psihiatrie la Universitatea din California, San Francisco. Sanders a fost unul dintre liderii studiului în presă.”nu corespunde cu efectul protector feminin, pentru care există dovezi substanțiale și care nu ar prezice un exces de variante transmise paternal în nicio clasă de variații”, spune el.Sebat spune că rezultatele nu sunt în contradicție cu această teorie., El spune că autismul ar putea rezulta dintr-o combinație a unei mutații puternice de codificare moștenită de la mamă și o mutație mai puțin puternică de codare moștenită de la tată.echipa sa intenționează să analizeze mai multe genomuri întregi pe măsură ce devin disponibile. Cu o dimensiune mai mare a eșantionului, spune Sebat, el va putea testa această ipoteză „cu două lovituri”. Echipa sa explorează, de asemenea, efectele mutațiilor noncoding pe care le-au descoperit.